2012年度国家自然科学基金委员会生命科学部重点项目申请方式根据学科的特点进行了调整。一些学科（如植物、微生物、生化、免疫、神经、生理、遗传、细胞和发育学）申请方式以立项领域宏观指导申请为主，有条件的“非领域申请”为辅。另外一些学科（如林学、生态、组织工程、食品、农学、园艺、植保、畜牧、兽医、水产和动物学科）不受理非领域申请重点项目，只按立项领域申请。
在中期检查与结题验收方面，国家自然科学基金委员会生命科学部重点项目中期检查会议改为中期进展学术交流会，旨在加强交流，在交流中达到检查的目的；重点项目结题验收继续试行同行专家通讯评议方式，网上公布项目完成情况，以达到减少专家出行，提高工作效率，增强项目完成透明度的目的。
本次学术交流会邀请了52位专家对执行到中期的86个项目进行交流，专家组最终通过投票方式评出中期成果。为提高工作效率，会议采用了电子投票系统。在国家自然科学基金委员会信息中心的支持下，国家自然科学基金委员会生命科学部将进行检查的项目申请书、研究计划任务书、中期进展情况简介等全部制作成电子会议文件，减少了大量纸张耗费。
此外，本次学术交流会采用电子投票系统，评审专家可根据学部需求自动设计投票方式，大大提高了工作效率。杜生明说，这一方式也将在2012年度国家自然科学基金委员会生命科学部重点项目评审会中推广使用。